La cirugía neonatal juntamente con el equipamiento de alta complejidad existente en la unidad de terapia neonatal, la posibilidad de diagnósticos por imágenes de distintas malformaciones, incluso prenatales y la excelencia médica del servicio, permitió desarrollar un programa para la corrección quirúrgica de muchas patologías en el neonato.
Es posible también efectuar el tratamiento de urgencias imprevistas y de otras patologías propias del recién nacido. La Unidad de Cirugía Neonatal cuenta con una guardia permanente de cirugía y un equipo de anestesistas especializados en este grupo etario. La experiencia del grupo interdisciplinario permite la resolución de diversas patologías quirúrgicas en recién nacidos de término, prematuros e incluso en neonatos de muy bajo peso, con resultados muy alentadores en la sobrevida y en la recuperación funcional del paciente.
El trabajo interdisciplinario y tecnológico permite en el servicio corregir patologías quirúrgicas que requieren de una delicada precisión y conocimiento técnico. La cirugía es un elemento indispensable para conformar un servicio al mas alto nivel médico.